Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TCIRG1Q13488 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TCIRG1Q13488 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCIRG1Q13488 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
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