Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
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