Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXD4Q12950 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXD4Q12950 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms