Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFX4

Putative uncharacterized protein LOC100128554, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q0VFX4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Q0VFX4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q0VFX4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q0VFX4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Q0VFX4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q0VFX4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q0VFX4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q0VFX4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q0VFX4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q0VFX4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q0VFX4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q0VFX4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q0VFX4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q0VFX4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q0VFX4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q0VFX4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q0VFX4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Q0VFX4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q0VFX4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q0VFX4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q0VFX4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q0VFX4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q0VFX4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q0VFX4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q0VFX4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Q0VFX4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q0VFX4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q0VFX4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q0VFX4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q0VFX4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q0VFX4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q0VFX4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q0VFX4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q0VFX4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q0VFX4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q0VFX4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Q0VFX4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q0VFX4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Q0VFX4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Q0VFX4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Q0VFX4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Q0VFX4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q0VFX4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q0VFX4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q0VFX4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q0VFX4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q0VFX4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q0VFX4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q0VFX4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q0VFX4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q0VFX4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q0VFX4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q0VFX4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q0VFX4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q0VFX4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q0VFX4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q0VFX4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q0VFX4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q0VFX4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q0VFX4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q0VFX4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q0VFX4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q0VFX4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q0VFX4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Q0VFX4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q0VFX4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q0VFX4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q0VFX4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q0VFX4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q0VFX4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q0VFX4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q0VFX4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q0VFX4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q0VFX4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q0VFX4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q0VFX4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q0VFX4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q0VFX4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q0VFX4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q0VFX4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q0VFX4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q0VFX4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q0VFX4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q0VFX4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q0VFX4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q0VFX4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q0VFX4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q0VFX4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q0VFX4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Q0VFX4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q0VFX4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q0VFX4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q0VFX4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q0VFX4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q0VFX4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q0VFX4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q0VFX4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q0VFX4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q0VFX4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q0VFX4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms