Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DHX9Q08211 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHX9Q08211 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms