Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF4Q08170 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF4Q08170 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms