Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXM1Q08050 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXM1Q08050 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms