Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SCN1BQ07699 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SCN1BQ07699 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms