Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNP2Q05952 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNP2Q05952 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNP2Q05952 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNP2Q05952 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNP2Q05952 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNP2Q05952 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNP2Q05952 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNP2Q05952 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNP2Q05952 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNP2Q05952 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNP2Q05952 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNP2Q05952 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNP2Q05952 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNP2Q05952 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNP2Q05952 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNP2Q05952 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNP2Q05952 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNP2Q05952 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNP2Q05952 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNP2Q05952 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNP2Q05952 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNP2Q05952 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNP2Q05952 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNP2Q05952 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNP2Q05952 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNP2Q05952 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNP2Q05952 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNP2Q05952 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TNP2Q05952 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNP2Q05952 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNP2Q05952 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNP2Q05952 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNP2Q05952 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TNP2Q05952 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNP2Q05952 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNP2Q05952 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TNP2Q05952 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TNP2Q05952 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms