Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNC4Q03721 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNC4Q03721 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms