Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ROM1Q03395 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ROM1Q03395 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms