Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNFAIP2Q03169 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP2Q03169 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms