Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNTN2Q02246 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTN2Q02246 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms