Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDK16Q00536 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK16Q00536 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms