Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX1P78414 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX1P78414 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX1P78414 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX1P78414 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX1P78414 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX1P78414 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX1P78414 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX1P78414 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX1P78414 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX1P78414 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX1P78414 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX1P78414 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX1P78414 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX1P78414 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX1P78414 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX1P78414 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX1P78414 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX1P78414 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX1P78414 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX1P78414 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX1P78414 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX1P78414 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX1P78414 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX1P78414 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX1P78414 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX1P78414 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX1P78414 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX1P78414 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX1P78414 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX1P78414 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX1P78414 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX1P78414 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX1P78414 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX1P78414 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX1P78414 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX1P78414 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX1P78414 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX1P78414 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX1P78414 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX1P78414 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX1P78414 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX1P78414 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX1P78414 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX1P78414 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX1P78414 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX1P78414 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX1P78414 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX1P78414 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX1P78414 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX1P78414 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX1P78414 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX1P78414 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX1P78414 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX1P78414 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX1P78414 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX1P78414 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX1P78414 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX1P78414 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX1P78414 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX1P78414 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRX1P78414 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX1P78414 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX1P78414 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX1P78414 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX1P78414 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX1P78414 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX1P78414 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX1P78414 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX1P78414 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRX1P78414 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IRX1P78414 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX1P78414 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX1P78414 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX1P78414 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX1P78414 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRX1P78414 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRX1P78414 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRX1P78414 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRX1P78414 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRX1P78414 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRX1P78414 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRX1P78414 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRX1P78414 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
IRX1P78414 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRX1P78414 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRX1P78414 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRX1P78414 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRX1P78414 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX1P78414 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX1P78414 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX1P78414 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX1P78414 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX1P78414 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX1P78414 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX1P78414 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX1P78414 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX1P78414 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX1P78414 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRX1P78414 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms