Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
UBE2HP62256 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
UBE2HP62256 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE2HP62256 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE2HP62256 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBE2HP62256 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms