Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO4P61968 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO4P61968 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO4P61968 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO4P61968 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO4P61968 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO4P61968 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO4P61968 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO4P61968 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO4P61968 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO4P61968 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO4P61968 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO4P61968 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO4P61968 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO4P61968 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO4P61968 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO4P61968 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO4P61968 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO4P61968 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO4P61968 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO4P61968 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO4P61968 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO4P61968 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO4P61968 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO4P61968 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO4P61968 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO4P61968 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO4P61968 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO4P61968 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO4P61968 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO4P61968 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO4P61968 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO4P61968 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO4P61968 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO4P61968 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO4P61968 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO4P61968 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO4P61968 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO4P61968 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO4P61968 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO4P61968 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO4P61968 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO4P61968 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO4P61968 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO4P61968 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO4P61968 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO4P61968 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO4P61968 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO4P61968 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO4P61968 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO4P61968 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO4P61968 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO4P61968 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO4P61968 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO4P61968 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO4P61968 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO4P61968 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO4P61968 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO4P61968 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO4P61968 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMO4P61968 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMO4P61968 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LMO4P61968 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMO4P61968 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMO4P61968 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMO4P61968 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LMO4P61968 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMO4P61968 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMO4P61968 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMO4P61968 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMO4P61968 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMO4P61968 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMO4P61968 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LMO4P61968 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMO4P61968 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMO4P61968 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMO4P61968 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMO4P61968 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMO4P61968 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMO4P61968 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMO4P61968 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMO4P61968 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMO4P61968 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMO4P61968 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMO4P61968 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LMO4P61968 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LMO4P61968 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LMO4P61968 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LMO4P61968 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LMO4P61968 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LMO4P61968 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LMO4P61968 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LMO4P61968 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LMO4P61968 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LMO4P61968 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LMO4P61968 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LMO4P61968 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LMO4P61968 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LMO4P61968 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LMO4P61968 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms