Protein–RNA interactions for Protein: P61163

ACTR1A, Alpha-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1AP61163 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTR1AP61163 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR1AP61163 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTR1AP61163 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTR1AP61163 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTR1AP61163 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTR1AP61163 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms