Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SNAP25P60880 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNAP25P60880 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms