Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHBDL3P58872 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RHBDL3P58872 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RHBDL3P58872 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms