Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP4P57796 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP4P57796 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP4P57796 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP4P57796 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP4P57796 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP4P57796 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CABP4P57796 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CABP4P57796 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CABP4P57796 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CABP4P57796 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CABP4P57796 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CABP4P57796 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CABP4P57796 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP4P57796 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP4P57796 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CABP4P57796 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP4P57796 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP4P57796 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP4P57796 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP4P57796 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP4P57796 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP4P57796 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP4P57796 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CABP4P57796 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP4P57796 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP4P57796 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP4P57796 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP4P57796 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP4P57796 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP4P57796 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP4P57796 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP4P57796 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP4P57796 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CABP4P57796 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP4P57796 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP4P57796 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP4P57796 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CABP4P57796 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CABP4P57796 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP4P57796 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP4P57796 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP4P57796 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP4P57796 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CABP4P57796 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP4P57796 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP4P57796 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP4P57796 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP4P57796 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP4P57796 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP4P57796 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP4P57796 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CABP4P57796 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP4P57796 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP4P57796 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP4P57796 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP4P57796 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP4P57796 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP4P57796 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CABP4P57796 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP4P57796 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP4P57796 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP4P57796 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CABP4P57796 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP4P57796 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP4P57796 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP4P57796 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP4P57796 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP4P57796 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP4P57796 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CABP4P57796 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP4P57796 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP4P57796 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP4P57796 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CABP4P57796 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP4P57796 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP4P57796 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP4P57796 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP4P57796 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP4P57796 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP4P57796 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP4P57796 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CABP4P57796 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP4P57796 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP4P57796 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP4P57796 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP4P57796 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP4P57796 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP4P57796 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP4P57796 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP4P57796 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CABP4P57796 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP4P57796 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP4P57796 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP4P57796 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP4P57796 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP4P57796 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP4P57796 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP4P57796 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CABP4P57796 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms