Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EEFSECP57772 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EEFSECP57772 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms