Protein–RNA interactions for Protein: P57730

CARD18, Caspase recruitment domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD18P57730 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD18P57730 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD18P57730 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD18P57730 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD18P57730 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD18P57730 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD18P57730 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD18P57730 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD18P57730 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD18P57730 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD18P57730 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD18P57730 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CARD18P57730 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD18P57730 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD18P57730 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD18P57730 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD18P57730 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD18P57730 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD18P57730 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD18P57730 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD18P57730 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD18P57730 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD18P57730 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CARD18P57730 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD18P57730 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD18P57730 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD18P57730 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD18P57730 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD18P57730 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD18P57730 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD18P57730 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD18P57730 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD18P57730 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD18P57730 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD18P57730 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD18P57730 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD18P57730 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CARD18P57730 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CARD18P57730 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CARD18P57730 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CARD18P57730 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CARD18P57730 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CARD18P57730 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CARD18P57730 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CARD18P57730 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CARD18P57730 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CARD18P57730 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CARD18P57730 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CARD18P57730 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CARD18P57730 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CARD18P57730 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CARD18P57730 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CARD18P57730 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CARD18P57730 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CARD18P57730 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CARD18P57730 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CARD18P57730 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CARD18P57730 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CARD18P57730 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CARD18P57730 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CARD18P57730 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CARD18P57730 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CARD18P57730 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CARD18P57730 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CARD18P57730 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CARD18P57730 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CARD18P57730 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CARD18P57730 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CARD18P57730 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CARD18P57730 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CARD18P57730 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CARD18P57730 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CARD18P57730 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CARD18P57730 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CARD18P57730 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CARD18P57730 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CARD18P57730 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CARD18P57730 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CARD18P57730 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CARD18P57730 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD18P57730 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD18P57730 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD18P57730 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD18P57730 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD18P57730 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD18P57730 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD18P57730 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD18P57730 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD18P57730 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CARD18P57730 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD18P57730 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD18P57730 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD18P57730 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD18P57730 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD18P57730 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD18P57730 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD18P57730 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD18P57730 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD18P57730 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CARD18P57730 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms