Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF3P57682 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF3P57682 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF3P57682 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF3P57682 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF3P57682 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF3P57682 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF3P57682 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF3P57682 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF3P57682 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF3P57682 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF3P57682 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF3P57682 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF3P57682 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF3P57682 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF3P57682 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF3P57682 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF3P57682 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF3P57682 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF3P57682 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF3P57682 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF3P57682 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF3P57682 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF3P57682 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF3P57682 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF3P57682 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF3P57682 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF3P57682 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF3P57682 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF3P57682 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF3P57682 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF3P57682 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF3P57682 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF3P57682 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF3P57682 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF3P57682 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLF3P57682 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLF3P57682 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLF3P57682 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLF3P57682 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLF3P57682 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF3P57682 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF3P57682 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF3P57682 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF3P57682 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF3P57682 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF3P57682 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF3P57682 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF3P57682 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF3P57682 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF3P57682 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF3P57682 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF3P57682 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF3P57682 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF3P57682 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF3P57682 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF3P57682 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF3P57682 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF3P57682 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF3P57682 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF3P57682 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF3P57682 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF3P57682 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF3P57682 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF3P57682 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF3P57682 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF3P57682 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF3P57682 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF3P57682 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF3P57682 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF3P57682 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF3P57682 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF3P57682 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF3P57682 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF3P57682 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF3P57682 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF3P57682 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF3P57682 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF3P57682 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF3P57682 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF3P57682 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF3P57682 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF3P57682 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF3P57682 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF3P57682 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF3P57682 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF3P57682 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF3P57682 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF3P57682 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF3P57682 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF3P57682 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF3P57682 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF3P57682 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF3P57682 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF3P57682 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF3P57682 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF3P57682 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF3P57682 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF3P57682 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF3P57682 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms