Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN8P56748 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLDN8P56748 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN8P56748 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms