Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX10P56693 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX10P56693 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX10P56693 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX10P56693 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX10P56693 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX10P56693 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX10P56693 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX10P56693 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX10P56693 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX10P56693 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX10P56693 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX10P56693 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX10P56693 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX10P56693 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX10P56693 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX10P56693 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX10P56693 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX10P56693 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX10P56693 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX10P56693 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX10P56693 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX10P56693 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX10P56693 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX10P56693 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX10P56693 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX10P56693 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX10P56693 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX10P56693 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX10P56693 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX10P56693 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX10P56693 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX10P56693 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX10P56693 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX10P56693 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX10P56693 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX10P56693 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX10P56693 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX10P56693 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX10P56693 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX10P56693 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX10P56693 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX10P56693 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX10P56693 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX10P56693 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX10P56693 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX10P56693 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX10P56693 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX10P56693 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX10P56693 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX10P56693 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX10P56693 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX10P56693 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX10P56693 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX10P56693 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX10P56693 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX10P56693 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX10P56693 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX10P56693 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX10P56693 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX10P56693 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX10P56693 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX10P56693 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX10P56693 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX10P56693 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX10P56693 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX10P56693 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX10P56693 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX10P56693 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX10P56693 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX10P56693 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX10P56693 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX10P56693 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX10P56693 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX10P56693 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX10P56693 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX10P56693 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX10P56693 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX10P56693 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX10P56693 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX10P56693 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX10P56693 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX10P56693 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX10P56693 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX10P56693 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX10P56693 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX10P56693 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX10P56693 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX10P56693 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX10P56693 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX10P56693 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX10P56693 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX10P56693 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX10P56693 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX10P56693 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX10P56693 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX10P56693 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX10P56693 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX10P56693 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SOX10P56693 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms