Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTSWP56202 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTSWP56202 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTSWP56202 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTSWP56202 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTSWP56202 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTSWP56202 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTSWP56202 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTSWP56202 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CTSWP56202 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTSWP56202 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTSWP56202 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTSWP56202 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTSWP56202 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CTSWP56202 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTSWP56202 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTSWP56202 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTSWP56202 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTSWP56202 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTSWP56202 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTSWP56202 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTSWP56202 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTSWP56202 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTSWP56202 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CTSWP56202 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTSWP56202 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTSWP56202 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CTSWP56202 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CTSWP56202 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTSWP56202 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTSWP56202 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTSWP56202 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CTSWP56202 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTSWP56202 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTSWP56202 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTSWP56202 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CTSWP56202 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CTSWP56202 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CTSWP56202 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CTSWP56202 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTSWP56202 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTSWP56202 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTSWP56202 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTSWP56202 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTSWP56202 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTSWP56202 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTSWP56202 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTSWP56202 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTSWP56202 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTSWP56202 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTSWP56202 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTSWP56202 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTSWP56202 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTSWP56202 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTSWP56202 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTSWP56202 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTSWP56202 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTSWP56202 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTSWP56202 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTSWP56202 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTSWP56202 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTSWP56202 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTSWP56202 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTSWP56202 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTSWP56202 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTSWP56202 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTSWP56202 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTSWP56202 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTSWP56202 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTSWP56202 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTSWP56202 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTSWP56202 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTSWP56202 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CTSWP56202 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTSWP56202 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTSWP56202 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CTSWP56202 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTSWP56202 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTSWP56202 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTSWP56202 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTSWP56202 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTSWP56202 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTSWP56202 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTSWP56202 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTSWP56202 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CTSWP56202 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTSWP56202 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTSWP56202 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTSWP56202 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTSWP56202 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTSWP56202 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTSWP56202 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTSWP56202 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTSWP56202 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTSWP56202 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTSWP56202 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTSWP56202 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTSWP56202 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTSWP56202 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTSWP56202 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms