Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLTPP55058 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLTPP55058 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLTPP55058 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLTPP55058 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLTPP55058 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLTPP55058 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLTPP55058 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLTPP55058 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLTPP55058 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLTPP55058 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLTPP55058 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLTPP55058 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLTPP55058 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLTPP55058 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLTPP55058 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLTPP55058 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLTPP55058 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLTPP55058 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLTPP55058 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLTPP55058 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLTPP55058 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLTPP55058 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLTPP55058 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLTPP55058 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLTPP55058 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLTPP55058 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLTPP55058 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLTPP55058 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLTPP55058 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLTPP55058 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLTPP55058 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLTPP55058 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLTPP55058 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLTPP55058 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLTPP55058 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLTPP55058 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLTPP55058 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLTPP55058 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLTPP55058 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PLTPP55058 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLTPP55058 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLTPP55058 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLTPP55058 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLTPP55058 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLTPP55058 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLTPP55058 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLTPP55058 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLTPP55058 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLTPP55058 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLTPP55058 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLTPP55058 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLTPP55058 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLTPP55058 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLTPP55058 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLTPP55058 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLTPP55058 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLTPP55058 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLTPP55058 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PLTPP55058 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLTPP55058 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PLTPP55058 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLTPP55058 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLTPP55058 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLTPP55058 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLTPP55058 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLTPP55058 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLTPP55058 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLTPP55058 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLTPP55058 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLTPP55058 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLTPP55058 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLTPP55058 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLTPP55058 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLTPP55058 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLTPP55058 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLTPP55058 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLTPP55058 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLTPP55058 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms