Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YARSP54577 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YARSP54577 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YARSP54577 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
YARSP54577 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
YARSP54577 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
YARSP54577 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YARSP54577 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YARSP54577 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YARSP54577 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
YARSP54577 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YARSP54577 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YARSP54577 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YARSP54577 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YARSP54577 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YARSP54577 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YARSP54577 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YARSP54577 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YARSP54577 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YARSP54577 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YARSP54577 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YARSP54577 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YARSP54577 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YARSP54577 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YARSP54577 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YARSP54577 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YARSP54577 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YARSP54577 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YARSP54577 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YARSP54577 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YARSP54577 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YARSP54577 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
YARSP54577 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YARSP54577 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YARSP54577 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YARSP54577 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YARSP54577 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YARSP54577 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YARSP54577 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YARSP54577 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YARSP54577 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YARSP54577 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YARSP54577 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YARSP54577 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
YARSP54577 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
YARSP54577 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
YARSP54577 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
YARSP54577 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
YARSP54577 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YARSP54577 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YARSP54577 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YARSP54577 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YARSP54577 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YARSP54577 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YARSP54577 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YARSP54577 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
YARSP54577 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YARSP54577 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YARSP54577 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YARSP54577 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YARSP54577 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YARSP54577 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YARSP54577 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YARSP54577 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YARSP54577 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YARSP54577 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YARSP54577 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YARSP54577 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
YARSP54577 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YARSP54577 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YARSP54577 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YARSP54577 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
YARSP54577 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YARSP54577 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
YARSP54577 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YARSP54577 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YARSP54577 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YARSP54577 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YARSP54577 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YARSP54577 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YARSP54577 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YARSP54577 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YARSP54577 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YARSP54577 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YARSP54577 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YARSP54577 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YARSP54577 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YARSP54577 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YARSP54577 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YARSP54577 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YARSP54577 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YARSP54577 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YARSP54577 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YARSP54577 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YARSP54577 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YARSP54577 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YARSP54577 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YARSP54577 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YARSP54577 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YARSP54577 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms