Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS2P54278 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS2P54278 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PMS2P54278 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS2P54278 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS2P54278 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS2P54278 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS2P54278 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS2P54278 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS2P54278 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS2P54278 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS2P54278 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS2P54278 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS2P54278 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS2P54278 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS2P54278 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS2P54278 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS2P54278 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS2P54278 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS2P54278 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS2P54278 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS2P54278 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS2P54278 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS2P54278 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS2P54278 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS2P54278 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS2P54278 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS2P54278 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS2P54278 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS2P54278 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS2P54278 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS2P54278 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS2P54278 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS2P54278 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS2P54278 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS2P54278 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS2P54278 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS2P54278 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS2P54278 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS2P54278 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS2P54278 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS2P54278 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS2P54278 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS2P54278 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS2P54278 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS2P54278 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS2P54278 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS2P54278 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS2P54278 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS2P54278 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS2P54278 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS2P54278 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS2P54278 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS2P54278 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS2P54278 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS2P54278 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS2P54278 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS2P54278 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS2P54278 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS2P54278 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS2P54278 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P54278 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P54278 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P54278 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P54278 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P54278 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P54278 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P54278 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P54278 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P54278 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P54278 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P54278 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P54278 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P54278 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS2P54278 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS2P54278 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS2P54278 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS2P54278 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS2P54278 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS2P54278 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS2P54278 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS2P54278 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS2P54278 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS2P54278 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS2P54278 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS2P54278 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS2P54278 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS2P54278 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS2P54278 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS2P54278 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS2P54278 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS2P54278 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS2P54278 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS2P54278 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS2P54278 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS2P54278 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS2P54278 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS2P54278 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS2P54278 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS2P54278 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms