Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA8P53708 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA8P53708 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms