Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR1P51861 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDR1P51861 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDR1P51861 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDR1P51861 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDR1P51861 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDR1P51861 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDR1P51861 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDR1P51861 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDR1P51861 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDR1P51861 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDR1P51861 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDR1P51861 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDR1P51861 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDR1P51861 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDR1P51861 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDR1P51861 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDR1P51861 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDR1P51861 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDR1P51861 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDR1P51861 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDR1P51861 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDR1P51861 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDR1P51861 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR1P51861 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR1P51861 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR1P51861 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR1P51861 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR1P51861 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR1P51861 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR1P51861 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR1P51861 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR1P51861 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR1P51861 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR1P51861 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR1P51861 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR1P51861 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR1P51861 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR1P51861 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR1P51861 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR1P51861 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR1P51861 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR1P51861 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR1P51861 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR1P51861 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR1P51861 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR1P51861 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR1P51861 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR1P51861 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR1P51861 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR1P51861 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR1P51861 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR1P51861 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR1P51861 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR1P51861 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR1P51861 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR1P51861 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR1P51861 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR1P51861 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR1P51861 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR1P51861 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDR1P51861 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDR1P51861 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDR1P51861 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDR1P51861 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDR1P51861 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDR1P51861 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDR1P51861 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDR1P51861 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDR1P51861 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDR1P51861 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDR1P51861 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDR1P51861 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDR1P51861 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDR1P51861 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDR1P51861 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDR1P51861 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDR1P51861 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDR1P51861 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDR1P51861 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDR1P51861 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDR1P51861 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDR1P51861 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDR1P51861 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDR1P51861 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDR1P51861 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDR1P51861 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDR1P51861 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDR1P51861 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDR1P51861 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDR1P51861 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDR1P51861 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDR1P51861 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDR1P51861 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDR1P51861 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDR1P51861 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDR1P51861 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDR1P51861 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDR1P51861 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDR1P51861 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms