Protein–RNA interactions for Protein: P51825

AFF1, AF4/FMR2 family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF1P51825 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFF1P51825 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFF1P51825 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFF1P51825 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFF1P51825 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF1P51825 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF1P51825 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF1P51825 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF1P51825 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF1P51825 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF1P51825 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF1P51825 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF1P51825 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF1P51825 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AFF1P51825 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF1P51825 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF1P51825 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF1P51825 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF1P51825 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF1P51825 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF1P51825 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF1P51825 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF1P51825 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF1P51825 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF1P51825 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFF1P51825 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFF1P51825 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFF1P51825 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFF1P51825 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AFF1P51825 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFF1P51825 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFF1P51825 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AFF1P51825 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFF1P51825 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFF1P51825 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFF1P51825 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFF1P51825 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFF1P51825 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFF1P51825 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFF1P51825 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFF1P51825 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFF1P51825 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFF1P51825 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFF1P51825 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AFF1P51825 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFF1P51825 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFF1P51825 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFF1P51825 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFF1P51825 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFF1P51825 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFF1P51825 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFF1P51825 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFF1P51825 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFF1P51825 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFF1P51825 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFF1P51825 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFF1P51825 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF1P51825 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF1P51825 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF1P51825 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF1P51825 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF1P51825 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF1P51825 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF1P51825 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFF1P51825 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF1P51825 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF1P51825 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF1P51825 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF1P51825 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF1P51825 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF1P51825 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF1P51825 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF1P51825 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFF1P51825 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFF1P51825 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFF1P51825 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFF1P51825 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFF1P51825 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFF1P51825 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFF1P51825 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFF1P51825 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFF1P51825 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFF1P51825 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFF1P51825 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFF1P51825 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF1P51825 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF1P51825 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF1P51825 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF1P51825 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF1P51825 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AFF1P51825 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFF1P51825 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFF1P51825 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFF1P51825 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFF1P51825 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFF1P51825 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AFF1P51825 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFF1P51825 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFF1P51825 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFF1P51825 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms