Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNA3P51805 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PLXNA3P51805 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA3P51805 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms