Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR5P51681 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR5P51681 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR5P51681 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR5P51681 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR5P51681 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR5P51681 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR5P51681 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR5P51681 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR5P51681 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR5P51681 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR5P51681 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR5P51681 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR5P51681 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR5P51681 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR5P51681 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR5P51681 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR5P51681 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR5P51681 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR5P51681 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR5P51681 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR5P51681 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR5P51681 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR5P51681 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR5P51681 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR5P51681 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR5P51681 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCR5P51681 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR5P51681 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR5P51681 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR5P51681 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCR5P51681 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCR5P51681 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR5P51681 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR5P51681 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR5P51681 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR5P51681 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR5P51681 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR5P51681 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR5P51681 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR5P51681 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR5P51681 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR5P51681 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR5P51681 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR5P51681 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR5P51681 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR5P51681 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR5P51681 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR5P51681 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR5P51681 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR5P51681 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR5P51681 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR5P51681 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR5P51681 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR5P51681 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR5P51681 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR5P51681 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR5P51681 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR5P51681 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR5P51681 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR5P51681 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR5P51681 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR5P51681 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR5P51681 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR5P51681 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR5P51681 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR5P51681 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR5P51681 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR5P51681 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR5P51681 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR5P51681 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR5P51681 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR5P51681 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR5P51681 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR5P51681 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR5P51681 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR5P51681 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR5P51681 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR5P51681 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR5P51681 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR5P51681 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR5P51681 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR5P51681 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR5P51681 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR5P51681 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR5P51681 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR5P51681 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCR5P51681 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCR5P51681 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR5P51681 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR5P51681 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR5P51681 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR5P51681 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR5P51681 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR5P51681 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR5P51681 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR5P51681 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR5P51681 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR5P51681 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR5P51681 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms