Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRCA2P51587 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRCA2P51587 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRCA2P51587 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms