Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A2P50993 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms