Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBP50607 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBP50607 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBP50607 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBP50607 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBP50607 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBP50607 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBP50607 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TUBP50607 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBP50607 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBP50607 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBP50607 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBP50607 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBP50607 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBP50607 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBP50607 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBP50607 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBP50607 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBP50607 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBP50607 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBP50607 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBP50607 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBP50607 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBP50607 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBP50607 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBP50607 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBP50607 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBP50607 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBP50607 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBP50607 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBP50607 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBP50607 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBP50607 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBP50607 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBP50607 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBP50607 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBP50607 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBP50607 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBP50607 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBP50607 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBP50607 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBP50607 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBP50607 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBP50607 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBP50607 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBP50607 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBP50607 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBP50607 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBP50607 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBP50607 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBP50607 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBP50607 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBP50607 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBP50607 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBP50607 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBP50607 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBP50607 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBP50607 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBP50607 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBP50607 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBP50607 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBP50607 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBP50607 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBP50607 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBP50607 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBP50607 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBP50607 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBP50607 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBP50607 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBP50607 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBP50607 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBP50607 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBP50607 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBP50607 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBP50607 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBP50607 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBP50607 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBP50607 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBP50607 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBP50607 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBP50607 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBP50607 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBP50607 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBP50607 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBP50607 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBP50607 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBP50607 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBP50607 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBP50607 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBP50607 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBP50607 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBP50607 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBP50607 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBP50607 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBP50607 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBP50607 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBP50607 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBP50607 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBP50607 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBP50607 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms