Protein–RNA interactions for Protein: P49917

LIG4, DNA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG4P49917 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LIG4P49917 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIG4P49917 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG4P49917 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG4P49917 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG4P49917 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG4P49917 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG4P49917 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG4P49917 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG4P49917 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG4P49917 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG4P49917 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG4P49917 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG4P49917 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG4P49917 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG4P49917 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG4P49917 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG4P49917 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG4P49917 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG4P49917 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG4P49917 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG4P49917 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG4P49917 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG4P49917 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG4P49917 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG4P49917 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG4P49917 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG4P49917 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG4P49917 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG4P49917 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG4P49917 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG4P49917 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG4P49917 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG4P49917 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LIG4P49917 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LIG4P49917 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LIG4P49917 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIG4P49917 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIG4P49917 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIG4P49917 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIG4P49917 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIG4P49917 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIG4P49917 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIG4P49917 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LIG4P49917 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIG4P49917 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIG4P49917 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIG4P49917 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIG4P49917 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIG4P49917 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG4P49917 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG4P49917 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG4P49917 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG4P49917 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG4P49917 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG4P49917 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG4P49917 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG4P49917 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG4P49917 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG4P49917 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG4P49917 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG4P49917 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG4P49917 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG4P49917 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG4P49917 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG4P49917 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG4P49917 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG4P49917 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG4P49917 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG4P49917 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIG4P49917 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIG4P49917 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIG4P49917 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIG4P49917 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIG4P49917 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LIG4P49917 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIG4P49917 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIG4P49917 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIG4P49917 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIG4P49917 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIG4P49917 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIG4P49917 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIG4P49917 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIG4P49917 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIG4P49917 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIG4P49917 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIG4P49917 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIG4P49917 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIG4P49917 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIG4P49917 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIG4P49917 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIG4P49917 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIG4P49917 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIG4P49917 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LIG4P49917 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIG4P49917 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIG4P49917 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIG4P49917 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIG4P49917 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIG4P49917 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms