Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPFP49454 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPFP49454 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPFP49454 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPFP49454 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPFP49454 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPFP49454 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPFP49454 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPFP49454 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPFP49454 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPFP49454 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPFP49454 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPFP49454 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPFP49454 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPFP49454 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPFP49454 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPFP49454 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPFP49454 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPFP49454 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPFP49454 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPFP49454 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPFP49454 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPFP49454 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPFP49454 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPFP49454 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPFP49454 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPFP49454 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPFP49454 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPFP49454 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPFP49454 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPFP49454 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPFP49454 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPFP49454 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPFP49454 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPFP49454 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPFP49454 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPFP49454 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPFP49454 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPFP49454 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPFP49454 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPFP49454 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CENPFP49454 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPFP49454 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPFP49454 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPFP49454 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPFP49454 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPFP49454 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPFP49454 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPFP49454 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPFP49454 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPFP49454 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPFP49454 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPFP49454 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPFP49454 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPFP49454 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPFP49454 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPFP49454 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPFP49454 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPFP49454 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPFP49454 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPFP49454 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPFP49454 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPFP49454 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPFP49454 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPFP49454 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPFP49454 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPFP49454 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPFP49454 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPFP49454 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPFP49454 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPFP49454 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPFP49454 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPFP49454 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPFP49454 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CENPFP49454 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPFP49454 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPFP49454 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPFP49454 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPFP49454 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPFP49454 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPFP49454 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPFP49454 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPFP49454 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPFP49454 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPFP49454 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPFP49454 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPFP49454 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPFP49454 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPFP49454 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPFP49454 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPFP49454 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPFP49454 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPFP49454 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPFP49454 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPFP49454 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPFP49454 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPFP49454 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPFP49454 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPFP49454 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPFP49454 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms