Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPIAP49247 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPIAP49247 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPIAP49247 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPIAP49247 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPIAP49247 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPIAP49247 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPIAP49247 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPIAP49247 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPIAP49247 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPIAP49247 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPIAP49247 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPIAP49247 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPIAP49247 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPIAP49247 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPIAP49247 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPIAP49247 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPIAP49247 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPIAP49247 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPIAP49247 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPIAP49247 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPIAP49247 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPIAP49247 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPIAP49247 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPIAP49247 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPIAP49247 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPIAP49247 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPIAP49247 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPIAP49247 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPIAP49247 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPIAP49247 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPIAP49247 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPIAP49247 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPIAP49247 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPIAP49247 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPIAP49247 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPIAP49247 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPIAP49247 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPIAP49247 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPIAP49247 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPIAP49247 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPIAP49247 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPIAP49247 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPIAP49247 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPIAP49247 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPIAP49247 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPIAP49247 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPIAP49247 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPIAP49247 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPIAP49247 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPIAP49247 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPIAP49247 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPIAP49247 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPIAP49247 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPIAP49247 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPIAP49247 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPIAP49247 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPIAP49247 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPIAP49247 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPIAP49247 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPIAP49247 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPIAP49247 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPIAP49247 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPIAP49247 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPIAP49247 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPIAP49247 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPIAP49247 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPIAP49247 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPIAP49247 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPIAP49247 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPIAP49247 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPIAP49247 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPIAP49247 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPIAP49247 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPIAP49247 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPIAP49247 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPIAP49247 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPIAP49247 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPIAP49247 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPIAP49247 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPIAP49247 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPIAP49247 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPIAP49247 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPIAP49247 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPIAP49247 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPIAP49247 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPIAP49247 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPIAP49247 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPIAP49247 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPIAP49247 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPIAP49247 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPIAP49247 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPIAP49247 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPIAP49247 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPIAP49247 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPIAP49247 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPIAP49247 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPIAP49247 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPIAP49247 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPIAP49247 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms