Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINT3P49223 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT3P49223 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms