Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A11P48066 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A11P48066 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms