Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN1BP46527 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDKN1BP46527 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms