Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RECQLP46063 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RECQLP46063 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RECQLP46063 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RECQLP46063 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RECQLP46063 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RECQLP46063 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RECQLP46063 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RECQLP46063 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RECQLP46063 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RECQLP46063 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RECQLP46063 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RECQLP46063 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RECQLP46063 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RECQLP46063 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RECQLP46063 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RECQLP46063 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQLP46063 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQLP46063 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQLP46063 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQLP46063 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQLP46063 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQLP46063 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQLP46063 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQLP46063 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQLP46063 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQLP46063 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQLP46063 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQLP46063 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQLP46063 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQLP46063 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQLP46063 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQLP46063 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQLP46063 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQLP46063 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQLP46063 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQLP46063 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQLP46063 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQLP46063 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQLP46063 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQLP46063 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQLP46063 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQLP46063 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQLP46063 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQLP46063 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQLP46063 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQLP46063 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQLP46063 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RECQLP46063 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RECQLP46063 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RECQLP46063 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RECQLP46063 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RECQLP46063 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RECQLP46063 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RECQLP46063 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RECQLP46063 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQLP46063 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQLP46063 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQLP46063 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQLP46063 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQLP46063 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQLP46063 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQLP46063 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQLP46063 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQLP46063 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RECQLP46063 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RECQLP46063 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RECQLP46063 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RECQLP46063 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RECQLP46063 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RECQLP46063 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RECQLP46063 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RECQLP46063 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RECQLP46063 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQLP46063 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQLP46063 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQLP46063 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQLP46063 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQLP46063 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQLP46063 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQLP46063 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQLP46063 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQLP46063 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQLP46063 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQLP46063 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQLP46063 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQLP46063 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQLP46063 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQLP46063 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQLP46063 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQLP46063 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQLP46063 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQLP46063 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQLP46063 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQLP46063 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQLP46063 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQLP46063 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQLP46063 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQLP46063 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQLP46063 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms