Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP5P45974 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP5P45974 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP5P45974 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP5P45974 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP5P45974 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP5P45974 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP5P45974 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP5P45974 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP5P45974 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP5P45974 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP5P45974 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP5P45974 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP5P45974 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP5P45974 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP5P45974 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP5P45974 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
USP5P45974 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP5P45974 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP5P45974 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
USP5P45974 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
USP5P45974 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
USP5P45974 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP5P45974 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP5P45974 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP5P45974 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP5P45974 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP5P45974 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP5P45974 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP5P45974 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP5P45974 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP5P45974 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP5P45974 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP5P45974 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP5P45974 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP5P45974 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP5P45974 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP5P45974 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP5P45974 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP5P45974 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP5P45974 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP5P45974 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP5P45974 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP5P45974 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP5P45974 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP5P45974 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP5P45974 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP5P45974 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP5P45974 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
USP5P45974 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP5P45974 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP5P45974 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP5P45974 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP5P45974 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP5P45974 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP5P45974 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP5P45974 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP5P45974 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP5P45974 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP5P45974 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP5P45974 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP5P45974 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP5P45974 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP5P45974 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP5P45974 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP5P45974 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP5P45974 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP5P45974 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
USP5P45974 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP5P45974 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
USP5P45974 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP5P45974 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP5P45974 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP5P45974 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP5P45974 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP5P45974 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP5P45974 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP5P45974 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP5P45974 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP5P45974 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP5P45974 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP5P45974 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP5P45974 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP5P45974 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP5P45974 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP5P45974 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP5P45974 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP5P45974 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP5P45974 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP5P45974 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP5P45974 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP5P45974 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP5P45974 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP5P45974 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP5P45974 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP5P45974 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP5P45974 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP5P45974 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP5P45974 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP5P45974 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms