Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSFMP43897 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSFMP43897 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSFMP43897 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSFMP43897 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSFMP43897 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSFMP43897 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSFMP43897 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSFMP43897 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSFMP43897 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSFMP43897 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSFMP43897 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSFMP43897 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSFMP43897 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSFMP43897 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSFMP43897 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSFMP43897 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSFMP43897 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSFMP43897 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSFMP43897 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSFMP43897 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSFMP43897 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSFMP43897 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSFMP43897 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSFMP43897 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSFMP43897 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSFMP43897 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSFMP43897 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSFMP43897 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSFMP43897 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSFMP43897 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSFMP43897 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSFMP43897 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSFMP43897 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TSFMP43897 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSFMP43897 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSFMP43897 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSFMP43897 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSFMP43897 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSFMP43897 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSFMP43897 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSFMP43897 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSFMP43897 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSFMP43897 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSFMP43897 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSFMP43897 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSFMP43897 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSFMP43897 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSFMP43897 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSFMP43897 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSFMP43897 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSFMP43897 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSFMP43897 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSFMP43897 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSFMP43897 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSFMP43897 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSFMP43897 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSFMP43897 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSFMP43897 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSFMP43897 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSFMP43897 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSFMP43897 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSFMP43897 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSFMP43897 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSFMP43897 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSFMP43897 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSFMP43897 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSFMP43897 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSFMP43897 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSFMP43897 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSFMP43897 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSFMP43897 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSFMP43897 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSFMP43897 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSFMP43897 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSFMP43897 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSFMP43897 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TSFMP43897 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSFMP43897 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSFMP43897 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSFMP43897 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSFMP43897 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TSFMP43897 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSFMP43897 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSFMP43897 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSFMP43897 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSFMP43897 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSFMP43897 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSFMP43897 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSFMP43897 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSFMP43897 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSFMP43897 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSFMP43897 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSFMP43897 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSFMP43897 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSFMP43897 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TSFMP43897 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSFMP43897 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSFMP43897 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSFMP43897 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms