Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAGEA3P43357 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEA3P43357 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEA3P43357 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms