Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC1A4P43007 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC1A4P43007 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms