Protein–RNA interactions for Protein: P37020

GEF1, Anion/proton exchange transporter GEF1, yeastyeast

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GEF1P37020 URA3YEL021W 804 nt6.87□□□□□ -1.31
GEF1P37020 YGL230CYGL230C 444 nt6.87□□□□□ -1.31
GEF1P37020 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.87□□□□□ -1.31
GEF1P37020 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.87□□□□□ -1.31
GEF1P37020 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.87□□□□□ -1.31
GEF1P37020 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.87□□□□□ -1.31
GEF1P37020 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.87□□□□□ -1.31
GEF1P37020 YKL177WYKL177W 339 nt6.87□□□□□ -1.31
GEF1P37020 FYV6YNL133C 522 nt6.87□□□□□ -1.31
GEF1P37020 YNR061CYNR061C 660 nt6.87□□□□□ -1.31
GEF1P37020 UBC11YOR339C 471 nt6.87□□□□□ -1.31
GEF1P37020 snR82snR82 268 nt6.86□□□□□ -1.31
GEF1P37020 CKA2YOR061W 1020 nt6.86□□□□□ -1.31
GEF1P37020 VMA4YOR332W 702 nt6.86□□□□□ -1.31
GEF1P37020 RBD2YPL246C 789 nt6.86□□□□□ -1.31
GEF1P37020 CMR3YPR013C 954 nt6.86□□□□□ -1.31
GEF1P37020 SEH1YGL100W 1050 nt6.85□□□□□ -1.31
GEF1P37020 CCS1YMR038C 750 nt6.85□□□□□ -1.31
GEF1P37020 SHE1YBL031W 1017 nt6.85□□□□□ -1.31
GEF1P37020 CYC2YOR037W 1101 nt6.85□□□□□ -1.31
GEF1P37020 LDH1YBR204C 1128 nt6.85□□□□□ -1.31
GEF1P37020 PUF3YLL013C 2640 nt6.85□□□□□ -1.31
GEF1P37020 YOR389WYOR389W 1875 nt6.85□□□□□ -1.31
GEF1P37020 NOG2YNR053C 1461 nt6.85□□□□□ -1.31
GEF1P37020 ABZ1YNR033W 2364 nt6.84□□□□□ -1.31
GEF1P37020 CYC8YBR112C 2901 nt6.84□□□□□ -1.31
GEF1P37020 KIN28YDL108W 921 nt6.84□□□□□ -1.31
GEF1P37020 snR7-LsnR7-L 214 nt6.84□□□□□ -1.31
GEF1P37020 CAB4YGR277C 918 nt6.84□□□□□ -1.31
GEF1P37020 SUP19tS(UGA)E 82 nt6.84□□□□□ -1.31
GEF1P37020 HTD2YHR067W 843 nt6.84□□□□□ -1.31
GEF1P37020 SUP17tS(UGA)I 82 nt6.84□□□□□ -1.31
GEF1P37020 SUP16tS(UGA)P 82 nt6.84□□□□□ -1.31
GEF1P37020 HIS6YIL020C 786 nt6.84□□□□□ -1.31
GEF1P37020 PLP2YOR281C 861 nt6.84□□□□□ -1.31
GEF1P37020 NPL4YBR170C 1743 nt6.84□□□□□ -1.31
GEF1P37020 PYC2YBR218C 3543 nt6.83□□□□□ -1.32
GEF1P37020 IMA3YIL172C 1770 nt6.83□□□□□ -1.32
GEF1P37020 IMA4YJL221C 1770 nt6.83□□□□□ -1.32
GEF1P37020 EST3YIL009C-A 546 nt6.83□□□□□ -1.32
GEF1P37020 DJP1YIR004W 1299 nt6.83□□□□□ -1.32
GEF1P37020 ICS3YJL077C 396 nt6.83□□□□□ -1.32
GEF1P37020 ERD2YBL040C 660 nt6.83□□□□□ -1.32
GEF1P37020 GRX5YPL059W 453 nt6.83□□□□□ -1.32
GEF1P37020 YPR071WYPR071W 636 nt6.83□□□□□ -1.32
GEF1P37020 ARA1YBR149W 1035 nt6.83□□□□□ -1.32
GEF1P37020 RPS9BYBR189W 588 nt6.83□□□□□ -1.32
GEF1P37020 APM3YBR288C 1452 nt6.83□□□□□ -1.32
GEF1P37020 ARG81YML099C 2643 nt6.82□□□□□ -1.32
GEF1P37020 MDH3YDL078C 1032 nt6.82□□□□□ -1.32
GEF1P37020 RDI1YDL135C 609 nt6.82□□□□□ -1.32
GEF1P37020 DON1YDR273W 1098 nt6.82□□□□□ -1.32
GEF1P37020 YDR278CYDR278C 318 nt6.82□□□□□ -1.32
GEF1P37020 YFR057WYFR057W 456 nt6.82□□□□□ -1.32
GEF1P37020 YUH1YJR099W 711 nt6.82□□□□□ -1.32
GEF1P37020 YAL069WYAL069W 315 nt6.82□□□□□ -1.32
GEF1P37020 DUS4YLR405W 1104 nt6.82□□□□□ -1.32
GEF1P37020 UFE1YOR075W 1041 nt6.82□□□□□ -1.32
GEF1P37020 RPN7YPR108W 1290 nt6.82□□□□□ -1.32
GEF1P37020 HRP1YOL123W 1605 nt6.82□□□□□ -1.32
GEF1P37020 SDS3YIL084C 984 nt6.81□□□□□ -1.32
GEF1P37020 RFA3YJL173C 369 nt6.81□□□□□ -1.32
GEF1P37020 TFS1YLR178C 660 nt6.81□□□□□ -1.32
GEF1P37020 YOL106WYOL106W 354 nt6.81□□□□□ -1.32
GEF1P37020 YOL163WYOL163W 510 nt6.81□□□□□ -1.32
GEF1P37020 ARL3YPL051W 597 nt6.81□□□□□ -1.32
GEF1P37020 PBP2YBR233W 1242 nt6.81□□□□□ -1.32
GEF1P37020 ARG4YHR018C 1392 nt6.81□□□□□ -1.32
GEF1P37020 RPT2YDL007W 1314 nt6.8□□□□□ -1.32
GEF1P37020 MDL1YLR188W 2088 nt6.8□□□□□ -1.32
GEF1P37020 RAD3YER171W 2337 nt6.8□□□□□ -1.32
GEF1P37020 CBP4YGR174C 513 nt6.8□□□□□ -1.32
GEF1P37020 PSF2YJL072C 642 nt6.8□□□□□ -1.32
GEF1P37020 YKR070WYKR070W 1059 nt6.8□□□□□ -1.32
GEF1P37020 GAT3YLR013W 426 nt6.8□□□□□ -1.32
GEF1P37020 USB1YLR132C 873 nt6.8□□□□□ -1.32
GEF1P37020 SEC72YLR292C 582 nt6.8□□□□□ -1.32
GEF1P37020 GSP1YLR293C 660 nt6.8□□□□□ -1.32
GEF1P37020 YBR144CYBR144C 315 nt6.8□□□□□ -1.32
GEF1P37020 FRS2YFL022C 1512 nt6.8□□□□□ -1.32
GEF1P37020 GPI11YDR302W 660 nt6.79□□□□□ -1.32
GEF1P37020 YGR176WYGR176W 348 nt6.79□□□□□ -1.32
GEF1P37020 GTT1YIR038C 705 nt6.79□□□□□ -1.32
GEF1P37020 SNO4YMR322C 714 nt6.79□□□□□ -1.32
GEF1P37020 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt6.79□□□□□ -1.32
GEF1P37020 HSP33YOR391C 714 nt6.79□□□□□ -1.32
GEF1P37020 HSP32YPL280W 714 nt6.79□□□□□ -1.32
GEF1P37020 VAN1YML115C 1608 nt6.79□□□□□ -1.32
GEF1P37020 SFB3YHR098C 2790 nt6.79□□□□□ -1.32
GEF1P37020 YHL044WYHL044W 708 nt6.78□□□□□ -1.32
GEF1P37020 BOS1YLR078C 735 nt6.78□□□□□ -1.32
GEF1P37020 UPS2YLR168C 693 nt6.78□□□□□ -1.32
GEF1P37020 VPS21YOR089C 633 nt6.78□□□□□ -1.32
GEF1P37020 PRP24YMR268C 1335 nt6.77□□□□□ -1.32
GEF1P37020 VPS4YPR173C 1314 nt6.77□□□□□ -1.32
GEF1P37020 AMD1YML035C 2433 nt6.77□□□□□ -1.33
GEF1P37020 SMF1YOL122C 1728 nt6.77□□□□□ -1.33
GEF1P37020 YDR391CYDR391C 699 nt6.77□□□□□ -1.33
GEF1P37020 DCV1YFR012W 609 nt6.77□□□□□ -1.33
GEF1P37020 PAN6YIL145C 930 nt6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.5 ms